代谢组+蛋白组

产品简介

从生物学角度来看,转录组学揭示了基因表达的现状,可以反映转录调控和转录后调控等机制,相比之下,蛋白质组学研究直接作用于生物体的蛋白质,而代谢组学研究生物系统受到刺激或干扰后随着时间推移发生代谢产物的变化,因此代谢组和蛋白组结合,一方面能够很好地印证表型的调控效应,另一方面也能够对分子作用机制进行补充阐释。

方法流程

产品优势

检测平台:利⽤顶级⾼分辨质谱仪和三重四极杆质谱仪,能够同时对上千种代谢物进⾏检测分析;

定性定量准:⾼分辨质谱仪检测到的⾼分辨⼆级谱图结合⾼分辨⼆级谱库能够更精准地鉴定代谢物,⽽三重四极杆MRM技术能够⾼灵敏度、宽⼴的动态范围进⾏定量检测,最终得到精准的定性定量数据;

数据库全面:自建植物物种专属代谢物数据库,数据库物质达到17000+;

物质类别广:全面覆盖苯丙素、黄酮、多酚、生物碱、萜类、香豆素、醌类等多种类型的次生代谢物,以及氨基酸、核苷酸、糖及醇类、维生素类、有机酸类、脂质等初生代谢物,共计17大类;

严格质控体系:仪器稳定性、物质残留、QC样本PCA及相关性等严格质控体系,保证数据质量;

检出物质多:单次检出1000+种代谢物,包括初生物质和次生物质;

售后完善:结题报告全面解读,代谢组文章写作全面辅导。

数据分析结果

CKD3_vs_WD3_ko00052_cor

相关性网络图

CKD3_vs_WD3_diff_Metabolites_subcluster_17

共表达趋势分析

CKD4_vs_WD4_diff_gene_meta_heatmap

相关性聚类分析

CKD4_vs_WD4.Integrated.KEGG.enrich

KEGG共富集分析

应用方向

1、动植物生长发育调控研究

2、动植物逆境胁迫调控研究

3、植物色泽调控研究

4、营养调控研究

5、中药成分基因挖掘

6、动物疾病调控研究

7、肿瘤的发生机制研究

8、药物作用靶点及机理研究

9、环境毒理研究

  

样本要求

植物组织:建议1g/重复,至少3个生物学重复;

血清/血浆:建议200ul/重复,至少3个生物学重复;

动物组织:建议200mg/重复,至少3个生物学重复。

文献案例

1、Sufficient coumarin accumulation improves apple resistance to Cytospora mali under high-potassium status.

代谢组学和蛋白质组学揭示钾营养调控苹果香豆素积累提高苹果树对腐烂病抗性的分子机制。

2、Core functional nodes and sex-specific pathways in human ischaemic and dilated cardiomyopathy.

人类缺血性和扩张性心肌病的核心功能节点和性别特异性通路。

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